لقد عمل المجلس منذ تاسيسه على تطوير عمله وتحسين ادائه بشكل متواصل حيث لم تقتصر انجازاته على تنفيذ المشاريع الاسكانية والبرامج المتصلة بتطوير قطاع الاسكان، وانما عمل بشكل متوازن على ترسيخ وتطوير تجربته من خلال ارساء قواعد عمل مهني واداري في اطار من المسؤولية والشفافية ومأسسة اتخاذ القرار.
حيث ان الظروف الجيوسياسية قد فرضت نفسها على نظام عمل المجلس وآلية اتخاذ القرارات، حيث كان لا بد من احداث هذه الملاءمة لتمكين المجلس من متابعة عمله والتي افترضت إقامة فرعي المحافظات الشمالية والذي يغطي ويتابع انشطة المجلس في مناطق الضفة الغربية، فيما يتابع فرع المحافظات الجنوبية برنامج وانشطة المجلس في مناطق قطاع غزة، كما يوجد منسق عام للمجلس يتولى التنسيق ما بين الفرعين.
فرع المحافظات الشمالية:
يدير ويشرف فرع المحافظات الشمالية على كافة انشطة المجلس في مناطق الضفة الغربية من خلال الادارة العامة للفرع التي يشرف على عملها، ويضع سياستها لجنة فرع الشمال والتي تمثل اعضاء مجلس الادارة من الضفة الغربية وعددهم تسعة اعضاء، فيما يسند لمدير المحافظات الشمالية متابعة تنفيذ هذه السياسات ومتابعة الاعمال اليومية للفرع، والذي بدوره يشرف ايضا على الدوائر المنبثقة عن الادارة العامة وهي:
الدائرة المالية: والتي تشرف على كافة الانشطة المالية والمحاسبية لفرع المحافظات الشمالية.
دائرة التسويق والقروض: تشرف على متابعة البرامج الاقراضية المختلفة وتسويق الشقق السكنية.
دائرة اعمار القدس: تشرف على انشطة وبرامج المجلس في مدينة القدس، ونظرا لخصوصية الوضع فان هذه الدائرة لها مكانتها الخاصة وجهازها الاداري والمهني الخاص.
دائرة الدراسات و المشاريع :و هي الدائرة التي تعنى باعداد الدراسات لاقامة مشاريع اسكانية يحتاجها المجتمع الفلسطيني بالشكل و المضمون الذي يمكن من توفير التموين لتنفيذها و من ثم متابعة تنفيذ هذه المشاريع على الأرض و اتاحة استخدامها بالشكل الأمثل للمستفيدين المستهدفين من شرائح المجتمع الفلسطيني
مكتب الشمال: يتابع انشطة المجلس وبرامجه في منطقة شمال الضفة الغربية.
مكتب الجنوب (الخليل): يتابع انشطة المجلس وبرامجه في منطقة جنوب الضفة الغربية.
يعمل في فرع المحافظات الشمالية (الضفة الغربية) طاقم اداري يتكون من (23) موظفا متفرغا موزعين على عدد من التخصصات وعلى كافة دوائر المجلس.
فرع المحافظات الجنوبية:
يدير ويشرف على انشطة وبرامج المجلس في المحافظات الجنوبية (قطاع غزة) من خلال لجنة فرع المحافظات الجنوبية وهم اعضاء مجلس الادارة من منطقة قطاع غزة، والذين بدورهم يقرون سياسة وبرامج المجلس فيها.
يدير اعمال الفرع مدير عام الفرع الذي يشرف على تنفيذ السياسات ومتابعة الاعمال اليومية للفرع من خلال الدوائر المختلفة هي:
دائرة الصيانة: تتابع وتشرف على اعمال الصيانة في المشاريع الاسكانية المختلفة.
الدائرة المالية: تشرف وتتابع الاعمال المالية والمحاسبية الخاصة بالفرع.
دائرة القروض والتسويق: تتابع وتشرف على البرامج الاقراضية وتسويق الشقق السكنية.
يعمل في فرع المحافظات الجنوبية (13) موظفا متفرغا موزعين على الدوائر والتخصصات المختلفة.
